中國農業(yè)科學院上海獸醫(yī)研究所位于上海市閔行區(qū),，成立于1964年,，其前身為中國農業(yè)科學院 家畜血吸蟲病研究室,，1982年更名為中國農業(yè)科學院上海家畜血吸蟲病研究所，1989年更名為中國農業(yè)科學院上海家畜寄生蟲病硏究所,，2002年被列為國家非營利性科研機構,，2006年更名為中國農業(yè)科學院上海獸醫(yī)硏究所，并成立中國動物衛(wèi)生與流行病學中心上海分中心,。2021年3月,，中國農業(yè)科學院委托研究所成立了生物安全研究中心。

　　以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導,，落實”四個面向""兩個一流”和"一個整體躍升”的總要求,，貫徹"人病獸防、關口前移,、源頭治理”的重要指示,，聚焦國家農業(yè)生物安全"主責主業(yè)"，圍 繞"國之大者"抓主抓重,，以重大動物疫情,、人畜共患病、重大外來病等為對象,，開展生物安全公共政策,、基礎理論、監(jiān)測預警,、技術攻關,、產品研發(fā)、集成應用等全鏈條研究,，為保障國家農業(yè)生物安全,、 科技自立自強提供戰(zhàn)略支撐。

　　研究所現(xiàn)有在職職工146名,，高級職稱專家77名,，碩博導師67人。內設7個行政管理部門和6個研 究室,，建立了11個創(chuàng)新科研團隊,。依托研究所建有國家防治血吸蟲病參考實驗室、農業(yè)農村部動物生 物安全風險預警及防控重點實驗室（北方）等10個科技平臺,，編輯出版《中國動物傳染病學報》。

　　建所以來,，承擔各類科研項目1000余項,。獲得國家省部級獎勵成果68項；獲得國家各類新獸藥證書15項,，其中一類新獸藥證書4項,；發(fā)表論文2800余篇,，其中SCI收錄論文1000余篇；出版專著76部,；獲得國家發(fā)明專利129件,。

　　研究所連續(xù)四屆被授予全國血防先進集體稱號，獲評第五屆全國文明單位,、歷屆上海市文明單位,，多次獲評中國農業(yè)科學院文明單位。