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一種新型豬細小病毒的鑒定和基因組特征分析

時間:2023-10-07   訪問量:1089

豬細小病毒(PPVs)是一類小型非包膜病毒,,目前已發(fā)現7種基因型(PPV1-7),。本研究通過高通量測序(HTS)技術,從廣東省豬繁殖與呼吸綜合征病毒陽性樣本中初步鑒定出一種新型PPV,,暫命名為PPV8,。PPV8-GDJM2021的近全長基因組長度為4380bp,有兩個重疊的開放閱讀框(ORF),,分別編碼NS1和VP1,。測序結果表明:PPV8在基因組水平上與PPV1-7的同源性為16.23%-44.18%,與PPV1的同源性相對最高,;PPV8-GDJM2021與PPV1和豬bufavirus(PBuV)NS1蛋白序列同源性為31.86-32.68%,,與原細小病毒屬成員相鄰,形成一個獨立的分支,。在1990—2021年收集的211份臨床樣本中,,有37份樣本(17.5%)檢出PPV8,這些樣本分布于我國12個地區(qū),,時間跨度長達24年(1998—2021年),。


原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36204286/












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