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一種檢測非洲豬瘟病毒(ASFV)的新型靈敏等溫擴(kuò)增技術(shù)的建立

時間:2023-02-20   訪問量:1037


01 一種檢測非洲豬瘟病毒(ASFV)的新型靈敏等溫擴(kuò)增技術(shù)的建立


A Arun Prince Milton,Samir Das,,Sabia Khan,K M Momin,,C B Prasad,H Kylla,,Sandeep Ghatak,,Arnab Sen
PMID:36740635   DOI:10.1007/s00705-023-05702-z


為在田間或資源受限情況下對臨床樣本開展檢測,本研究建立了一種快速,、簡便,、靈敏的非洲豬瘟病毒(ASFV)核酸檢測技術(shù)?;谑澜鐒游镄l(wèi)生組織(WOAH)推薦的p72基因引物,,首次采用跨越式滾環(huán)等溫擴(kuò)增(SRCA)技術(shù)檢測ASFV。檢測可在58°C等溫條件下于90 min完成,,不需復(fù)雜儀器,。因SYBR Green熒光染料的存在,可用肉眼判定結(jié)果,。該技術(shù)特異性為100%,,僅能擴(kuò)增ASFV陽性樣本,而與豬的其他致病性病毒和細(xì)菌無交叉反應(yīng),。SRCA、終點(diǎn)PCR和實(shí)時熒光PCR的檢測下限分別為48.4,、4.84×103和4.84×103 copies/μL,。因此,新建立的SRCA技術(shù)比終點(diǎn)PCR和實(shí)時熒光PCR靈敏100倍,。采用SRCA技術(shù)對2020—2022年期間從感染ASFV的家豬和其他疑似ASFV感染動物采集的臨床樣本進(jìn)行檢測,,結(jié)果發(fā)現(xiàn)準(zhǔn)確率為100%。結(jié)果表明,,SRCA是檢測ASFV的一種簡單,、敏感技術(shù),可提高實(shí)驗室現(xiàn)場診斷能力,,尤其是在疫情暴發(fā)期間,。由于成本低、特異性強(qiáng)、敏感性好,、用戶友好,、快速可靠、無需設(shè)備等優(yōu)點(diǎn),,這種新型診斷技術(shù)完全符合世界衛(wèi)生組織(WHO)倡導(dǎo)的疾病診斷“ASSURED”標(biāo)準(zhǔn),。因此,SRCA可能比其他復(fù)雜分子技術(shù)更適合ASFV診斷,。
原文鏈接:?https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36740635/

02 分離自印度的牛結(jié)節(jié)性皮膚病 病毒(LSDV)具有獨(dú)特譜系


Lenin Bhatt,,Rahul C Bhoyar,Bani Jolly,,Ravi Israni,,Harie Vignesh,Vinod Scaria,,Sridhar Sivasubbu
PMID:36740645    DOI:10.1007/s00705-023-05705-w
牛結(jié)節(jié)性皮膚病病毒(LSDV)以前僅限于在非洲地區(qū)傳播,,然而近年來,其已在全世界幾個區(qū)域引起了規(guī)模疫情,。2019年印度報告了一起LSD疫情,,此次疫情發(fā)病率低,未報告死亡病例,。2022年印度7個邦持續(xù)暴發(fā)LSDV疫情,,最終導(dǎo)致3個月內(nèi)損失8萬多頭牛。在印度拉賈斯坦邦疫情持續(xù)暴發(fā)期間,,從感染牛分離了6株LSDV,,并對其完整基因組序列進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,,與參考株相比,,2022年疫情分離毒株基因組具有大幅遺傳變異,并且形成了獨(dú)特的遺傳譜系,。因此,,應(yīng)加強(qiáng)基因組測序和跨界疫病病原體監(jiān)測,以跟蹤變異病原的出現(xiàn)和流行,。
原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36740645/

03 一起養(yǎng)殖鴨不明原因死亡疫情中禽肝病毒和圓環(huán)病毒的鑒定


Dianqi Zhang,,Yan Wang,Yumin He,,Likai Ji,,Kai Zhao,Shixing Yang,,Wen Zhang
PMID:36763177   DOI:10.1007/s00705-023-05719-4

病毒宏基因組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于疫病病原體研究,。使用該技術(shù),我們查明了導(dǎo)致鴨場大量鴨死亡的潛在病原體。經(jīng)檢測,,共鑒定出2株鴨圓環(huán)病毒(DuCV)和1株鴨乙型肝炎病毒(DHBV),,二者均與禽類病毒密切相關(guān)。2株DuCV與部分參考毒株全基因序列同源性為81.64%~97.65%,,DHBV分離株與其他毒株同源性為75.85%~98.92%,。病鴨臨床癥狀包括羽毛皺褶、嗜睡和體重減輕,,這與DuCV感染病例類似,。DuCV與DHBV合并感染是否導(dǎo)致肝損傷和疾病惡化,還需進(jìn)一步研究,。
原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36763177/










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