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科研動(dòng)態(tài)

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科研動(dòng)態(tài)

一種新型豬細(xì)小病毒的鑒定和基因組特征分析

時(shí)間:2023-10-07   訪問(wèn)量:1044

豬細(xì)小病毒(PPVs)是一類小型非包膜病毒,,目前已發(fā)現(xiàn)7種基因型(PPV1-7),。本研究通過(guò)高通量測(cè)序(HTS)技術(shù),,從廣東省豬繁殖與呼吸綜合征病毒陽(yáng)性樣本中初步鑒定出一種新型PPV,暫命名為PPV8,。PPV8-GDJM2021的近全長(zhǎng)基因組長(zhǎng)度為4380bp,,有兩個(gè)重疊的開(kāi)放閱讀框(ORF),分別編碼NS1和VP1,。測(cè)序結(jié)果表明:PPV8在基因組水平上與PPV1-7的同源性為16.23%-44.18%,,與PPV1的同源性相對(duì)最高,;PPV8-GDJM2021與PPV1和豬bufavirus(PBuV)NS1蛋白序列同源性為31.86-32.68%,,與原細(xì)小病毒屬成員相鄰,形成一個(gè)獨(dú)立的分支,。在1990—2021年收集的211份臨床樣本中,,有37份樣本(17.5%)檢出PPV8,這些樣本分布于我國(guó)12個(gè)地區(qū),,時(shí)間跨度長(zhǎng)達(dá)24年(1998—2021年),。


原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36204286/












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